一、药物治疗：抗菌治疗常用的是喹诺酮类药物，有环丙沙星、氧氟沙星等，这类药物杀菌作用比较强，在患者体内分布广泛，胆汁中的浓度比较高，副作用相对少并且不容易产生耐药性，所以在临床上可以用于副伤寒的首选治疗。
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第三代头孢菌素有抗副伤寒杆菌作用，敏感的菌株用药后数小时菌血症便可被控制，如头孢曲松。严重毒血症可在抗菌药物配合下使用糖皮质激素，如地塞米松或氢化可的松。但对兼有毒血症和显著鼓肠或腹泻患者应慎重，以防发生肠出血和肠穿孔。
二、手术治疗：对并发化脓性病灶，可以安排脓肿切开术排脓并加强抗菌治疗。对肠穿孔者可行手术治疗。
