提起细菌，人们大都会有一种厌恶的感觉，认为它是危害健康、危害人类的。其实，细菌有害亦有利。细菌在生生不息的物质循环中，以特有的新陈代谢形式，实现了化复杂为神奇的目的，给人类留下许多有益的财富。
一、人体肠道细菌分为三大类
在正常人体人体中95%左右的细菌存在于肠道，尤其是在大肠中。
一是有益菌。对身体健康有益处的细菌，如双歧杆菌和乳酸杆菌。主要是兼性厌氧菌，在生态平衡时，它们的维生素和蛋白质合成、消化吸收、生物拮抗和免疫等功能对宿主有利。
二条件性致病菌。在一定条件下对人体有害，但在一般情况下，对人体稍微有点好处，如大肠杆菌。即同时具有生理和致病两种作用。
三是致病菌。对人产生危害的细菌，如产气荚膜杆菌、绿脓杆菌等。正常情况下数量少，寄生于正常部位，不至于使宿主发病。若失控，则会导致宿主的不良反应。
随着年龄的增长，有益菌会越来越少，有害菌则不断增加，肠道亦随之逐渐老化。若能保持肠内的有益菌数量，维持菌群平衡，将有益于健康。
二、微生物菌群的平衡
微生物菌群的平衡，对机体的健康十分重要，而乳酸菌就能够调节这种微生态平衡，保障宿主正常生理状态。乳酸菌通过粘附素与肠粘膜细胞紧密结合，在肠粘膜表面定植占位，成为生理屏障的主要组成部分，从向达到恢复宿主抵抗力，修复肠道菌群屏障、治愈肠道疾病的作用。如采这个屏障遭到抗生素或其他因素的破坏，宿主丧失了对外来菌抵抗力，会使具有耐药性的肠内菌异常增殖而取代优势菌的位置，造成肠道内微生态平衡的失调。
三、有益菌与有害菌相互制约
肠道有益菌对人体的健康有着至关重要的作用。肠道内的有益菌与有害菌相互作用、相互制约，保持肠道菌群的平衡。当有益菌不足时，人体的微生物系统被打破，条件致病菌活跃、大量繁殖，造成菌体失调，导致腹泻、免疫力下降等症状，从而进一步加重菌群失调，形成恶性循环。
四、有益菌对人体的作用
1.合成多种维生素包括维生素K、叶酸等，肠道菌群失调可引起维生素K缺乏症，产生腹泻。
2.促进钙、铁、维生素D的吸收，有利于减缓老年人骨质疏松的过程。促进婴儿的发育。
3.制约有害菌的生成，阻止病原菌对人体的侵害，起到生物屏障作用；
4.提高机体的免疫力，肠道是人体最大的一个免疫器官，构筑成一个生物屏障。
5.降低胆固醇和血脂有益菌能降低抑制胆固醇的合成，阻止人体对胆固醇的吸收、利用等。，抑制有毒物质生成；
6.抑制肿瘤，益生菌能降解亚硝胺，消除亚硝胺的致癌性，而且促进肠道蠕动，减少诱发肠道肿瘤风险。
7.改善乳糖消化不耐受症。
五、如何保护肠道有益菌
1.平衡膳食：常吃蔬菜、水果、薯类、全谷类、豆类等富含膳食纤维的碱性食物，以改善肠道环境，促进有益菌的生长、抑制有害菌的繁殖。
2.缓解压力：精神压力容易造成肠道内菌群失调。
3.不滥用抗生素：长期服用抗生素，会造成肠道菌群失调，引起慢性腹泻。
4.食用适量益生菌如酸奶等，可以促进肠道微生物平衡。
六、双歧杆菌对人体的益处
双歧杆菌Bifidobacterium是年由法国学者Tissier从母乳营养儿的粪便中分离出的一种厌氧的革兰氏阳性杆菌，末端常常分叉，故名双歧杆菌。
双歧杆菌在母乳喂养儿肠道内大量存在，对婴幼儿有许多好处，如营养、免疫及抗感染作用。并且还具有抗过敏、抗肿瘤、调整肠道功能及改善营养的作用等。在临床上，双歧杆菌具有调整肠道功能紊乱作用。可以预防腹泻，减少便秘，即双向调节。这种调节能起到预防和治疗各种肠道疾病的效果。
双歧杆菌对慢性腹泻、治疗便秘有双重调节作用。
抗生素相关性肠炎实际上是抗生素的使用，使原来过路菌或外籍菌（如肠杆菌）成为优势种群，它们大量增殖或分泌相关毒素与肠粘膜上皮细胞受体结合后使CAMP酶活性升高，大量水盐电解质丢失，而造成腹泻症状。增殖双歧杆菌，扶植了肠道中的原籍菌，使机体定植抗力升高，有利于拮抗致病菌和条件致病菌的定植。双歧杆菌可治疗因大量使用抗生素而导致的伪膜性肠炎。
双歧杆菌，调整肠道正常菌群，将糖分解后生成乳酸和醋酸，使肠道呈酸性，其结果能控制由有害菌引起的异常发酵，并且刺激肠蠕动，起到解除便秘的作用。
七、乳酸菌的生理功能
凡是能从葡萄糖或乳糖的发酵过程中产生乳酸的细菌统称为乳酸菌。这是一群相当庞杂的细菌，目前至少可分为18个属，共有多种。除极少数外，其中绝大部分都是人体内必不可少的且具有重要生理功能的菌群，其广泛存在于人体的肠道中。目前已被国内外生物学家所证实，肠内乳酸菌与健康长寿有着非常密切的直接关系。
乳酸菌是一种存在于人类体内的益生菌。乳酸菌能够将碳水化合物发酵成乳酸，因而得名。益生菌能够帮助消化，有助人体肠脏的健康，因此常被视为健康食品，添加在酸奶之内。
1.防治黄种人普遍患有的乳糖不耐症（喝鲜奶时出现的腹胀、腹泻等症状）。
2．促进蛋白质、单糖及钙、镁等营养物质的吸收，产生维生素B族等大量有益物质。制造维生素，乳酸菌在肠道中可以制造人体所需的维生素,例如维他命k,b2,b6,b12,叶酸等。
3．使肠道菌群的构成发生有益变化，改善人体胃肠道功能，恢复人体肠道内菌群平衡，形成抗菌生物屏障，维护人体健康。
4．抑制腐败菌的繁殖，消解腐败菌产生的毒素，清除肠道垃圾。
5．抑制胆固醇吸收，降血脂、降血压作用。
6．免疫调节作用，增强人体免疫力和抵抗力。
7．抗肿瘤、预防癌症作用。预防癌症，乳酸菌在肠胃道中生长,由于有微生物族群的抗拮作用,会使产生致癌物的不良细菌大量减少,进而减少致癌几率.
8．提高SOD酶活力，消除人体自由基，具抗衰老、延年益寿作用。
9．有效预防女性泌尿生殖系统细菌感染。
10．控制人体内毒素水平，保护肝脏并增强肝脏的解毒、排毒功能。
11．帮助消化,保持肠道健康。乳酸菌能帮助消化,调整大,小肠的蠕动,以利肠道正常运作，防止腹泻。
12．消除便秘、乳酸菌所分泌的乳酸能增加大,小肠的蠕动,而且作用温和自然,不同于市面上的轻泻剂.
13．乳酸菌通过发酵产生的有机酸、特殊酶系、细菌表向成分等物质具有生理功能，可刺激组织发育，对机体的营养状态、生理功能、免疫反应和应激反应等产生作用。
14.提供营养物质，促进机体生长乳酸菌如果能在体内正常发挥代谢活性，就能直接为宿主提供可利用的必需氨基酸和各种维生素（维生素B族和K等)，还可提高矿物元素的生物活性，进而达到为宿主提必需营养物质、增强动物的营养代谢、直接促其生长的作用。
15.改善免疫能力，乳酸杆菌和双歧杆菌一方面能明显激活巨噬细胞的吞噬作用，另一方面由于它能在肠道定植，相当于天然自动免疫。它们还能刺激腹膜巨噬细胞、诱导产生干扰素、促进细胞分裂、产生抗体及促进细胞免疫等，所以能增强机体的非特异性和特异性免疫反应，提高机体的抗病能力。
16．抗菌作用研究资料表明：乳酸菌对一些腐败菌和低温细菌有较好的抑制作用。可用于防治腹泻、下痢、肠炎、便秘和由于肠道功能紊乱引起的多种疾病以及皮肤炎症。
其抗菌机制主要表现在以下几个方面：
①产生的乳酸等有机酸能显著降低环境pH值和Eh(氧化还原电位)值，使肠内处于酸性环境，对于致病菌如痢疾杆菌、伤寒杆菌、副伤寒杆菌、弯曲杆菌、葡萄球蔺等有拮抗作用；
②产生的过氧化氧能够激活牛乳中的“过氧化氢酶-硫氰酸”系统，抑制和杀灭革兰氏阴性菌、过氧化氢酶阳性细菌如假单胞菌属、大肠杆菌类和沙门氏菌属等；
③产生类似细菌素的细小蛋白质或肽类，如各种乳酸杆菌素和双歧菌素，对葡萄球菌、梭状芽胞肝阔以及沙门氏菌和志贺氏菌有拮抗作用。另外，双歧杆菌等还可将结合的胆酸分解为游离的肌酸，后者对细菌的抑制作用比前者更强。